Dalam serial Naruto banyak sekali shinobi hebat yang meninggal di usia prima dikarenakan suatu penyakit misterius yang tidak bisa disembuhkan. Banyak yang menyebut jika shinobi tersebut tidak dimatikan oleh MK maka akan dapat menandingi kemampuan atau bahkan mengalahkan karakter utama dari serial Naruto. Sehingga karakter-karakter ini sengaja dimatikan untuk menghidupkan alur cerita. Berikut shinobi yang meninggat karena penyakit :
1. Uchiha Itachi
Salah satu shinobi paling berbakat di serial Naruto yang merupakan kakak dari Uchiha Sasuke diceritakan rela menjalankan misi apapun demi kedamaian desa dan keselamatan adiknya. Sepanjang bejalannya seri Itachi tidak pernah diperlihatkan "benar-benar" kalah dalam pertarungan. Kematiannya saat bertarung dengan Sasuke juga lebih disebabkan oleh penyakitnya, lagipula pertarungan ini sudah dirancang Itachi untuk membuat Sasuke seolah-olah berhasil membunuhnya. Banyak yang menganggap penggunaan Mangekyou Sharingan Itachi yang berlebihan membuat penyakitnya semakin parah.
2. Kimimaru
Kimimaru merupakan keturunan clan Kaguya terakhir yang diketahui masih hidup setelah pemberontakan gagal mereka di Kirigakure. Sebagai anggota clan Kaguya Kimimaru dianugerahi kekkai genkai Shikotsumyaku yaitu kemampuan memanipulasi tulang sehingga meningkatkan variasi serangan dan daya tahan dalam pertempuran. Seperti halnya Itachi Kimimaru juga tidak pernah diperlihatkan mengalamai kekalahan dan sempat menjadi calon wadah Orochimaru tetapi saat akan melakukan invasi ke Konoha Kimimaru menderita penyakit misterius yang berujung pada kematiannya. Menurut Kabuto sedikitnya informasi mengenai clan Kaguya membuat pengobatan terhadap penyakit Kimimaru sangat sulit dilakukan.
3. Shin
Shin merupakan karakter yang dianggap kakak oleh Sai selama masa pelatihan di Anbu Ne Danzo. Ketika Danzo memaksa Shin dan Sai bertarung sampai mati demi menekan perasaan sebagai shinobi. Shin baru diketahui memiliki penyakit mematikan dan meminta Sai mealpor kepada Danzo bahwa dia telah berhasil membunuh Shin. Kemampuan Shin sebagai shinobi belum diperlihatkan secara utuh meski dalam bentuk edo tensei ia diperlihatkan cukup terampil melakukan kenjutsu dan taijutsu.
4. Ringo Ameyuri
Ringo Ameyuri merupakan salah satu dari 7 pendekar pedang Kirigakure. Ringo menggunakan pedang Kiba yang merupakan pedang kembar yang mampu menghasilkan elemen petir dan disebut yang tertajam dari kesemua 7 pedang Kiri. Ringo Ameyuri dikenal dengan sifatnya yang serakah dan senang bermain-main dengan musuhnya. Pada masa keemasan kelompok pendekar pedang ia meninggal di usia muda karena suatu penyakit misterius.
Itulah beberapa shinobi yang dimatikan oleh MK dengan penyakit demi pengembangan alur
